Quy chế được kết cấu gồm 04 Chương với 31 Điều như sau:

 

- Chương I. Quy định chung (06 Điều): phạm vi điều chỉnh; đối tượng áp dụng; giải thích từ ngữ; nguyên tắc thực hiện thủ tục hành chính trên môi trường điện tử; quyền, trách nhiệm và các hành vi không được làm của tổ chức, cá nhân; trách nhiệm và hành vi không được làm của cán bộ, công chức.

- Chương II. Quy định thực hiện thủ tục hành chính trên môi trường điện tử (17 Điều): Cổng dịch vụ công của Bộ; mã số hồ sơ thủ tục hành chính; phương thức thực hiện thủ tục hành chính; quy định đăng ký và đăng nhập tài khoản; chuẩn bị và nộp hồ sơ điện tử thực hiện thủ tục hành chính; yêu cầu cấp bản sao điện tử có giá trị pháp lý; tiếp nhận, chuyển xử lý thủ tục hành chính; giải quyết hồ sơ thủ tục hành chính; sửa đổi, bổ sung thông tin hồ sơ điện tử; tra cứu hồ sơ điện tử thủ tục hành chính; thanh toán trực tuyến trong giải quyết thủ tục hành chính; thông báo tình hình, kết quả giải quyết thủ tục hành chính; lưu trữ hồ sơ, kết quả giải quyết thủ tục hành chính; kho quản lý dữ liệu điện tử của tổ chức, cá nhân; đánh giá quá trình giải quyết thủ tục hành chính; chuyển đổi hồ sơ, kết quả giải quyết thủ tục hành chính điện tử ra văn bản giấy; tiếp nhận, xử lý phản ánh, kiến nghị về giải quyết hồ sơ thủ tục hành chính.

- Chương III. Quy định trách nhiệm thực hiện thủ tục hành chính trên môi trường điện tử (05 Điều): trách nhiệm của Văn phòng Bộ; trách nhiệm của Trung tâm Thông tin; trách nhiệm của Vụ Kế hoạch – Tài chính; trách nhiệm của cơ quan có thẩm quyền; trách nhiệm của tổ chức, cá nhân yêu cầu thực hiện thủ tục hành chính.

- Chương IV. Tổ chức thực hiện (03 Điều): chế độ báo cáo; khen thưởng, xử lý vi phạm; điều khoản thi hành.